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1 放射自显影期间膜对胶片的曝光时间不足。
2 核酸转移或结合在尼龙膜上的效率低
3 目标序列以非常低的拷贝数存在。增加加载到凝胶上的样品量。
4 没有足够数量的探针序列,增加探针的浓度或加入10%硫酸葡聚糖,这样减少了溶剂体积,可以到到相同的效果。
5 没有探针同源性。
6 双链DNA探针未变性,或者,探针检测仪性能下降。在使用RNA探针时发生可能更大。
7 探针的比活性太低。考虑诸如标记反应中的探针浓度、放射性标记的三磷酸盐的半衰期等因素。
8 杂交和/或洗涤过程中试验方法不佳:
1)增加盐的浓度。
2)降低温度。
3)降低SDS的浓度。
4)减少清洗时间。
5)杂交时间太短。